TaiBIF 2023年度成果盤點！！

過年啦～～♩♪♬
回首 2023 年，真的是發生了很多事情，不知不覺 TaiBIF 已經 20 歲！！是個成熟的大人了～✨✨✨
在此與大家分享我們這一年的成果，未來我們也將持續努力，並祝大家新春愉快！！❤️❤️❤️

🌱建置生物多樣性資訊基礎建設

先解釋一下什麼是資訊基礎建設？簡單來說，它主要是指支援資訊收集、整合、開放、分析等所需要的軟硬體基礎設施，包括資料庫、工具、伺服器、資料流、標準等等，也是 TaiBIF 主要對外提供的服務。

• TaiBIF 開放資料工具包 (Open Data Toolkit, ODT) 資料驗證工具：
  此工具結合資料標準模板、DwC詞彙、Excel 資料編輯功能介面、GBIF 資料驗證工具，以及 OpenRefine 資料清理等工具功能優點並中文化。另外亦建立資料清理的流程指引，讓介面功能貼近國內資料發布者的使用需求，也能較順暢無痛地管理及發布資料。未來待擴大測試完成後，會正式於官網上線，敬請期待！🔥🔥🔥

• 臺灣物種名錄 (TaiCOL) 改版上線：
  物種名錄為生物多樣性資料最基礎的資料，對於管理與溝通至關重要。舊版網站歷經 20 年的使用後已完成階段性任務， 2023 年改版後的新版臺灣物種名錄，串接了近年開發的 TaiCOL 學名管理工具，將可呈現更完整、客觀的名錄相關資訊，並提供更多元、彈性化的取得名錄功能。

• Darwin Core 詞彙中文化：
  配合 TaiBIF 開放資料工具包的開發，我們也將常用的 DwC 詞彙和說明中文化，並提供各欄位的「必填」、「強烈建議」、「選填」來協助資料發布者選擇欄位時作參考，未來也會正式發布相關文件喔！

• TaiBIF 資料庫應用程式介面 (API) ：
  此服務查詢內容包括出現紀錄、資料集與發布單位。

🌱推廣資料開放觀念

去年也是緊湊的一年，很開心不論是線上或實體，都有越來越多對於生物多樣性資訊有興趣的人來認識我們。來看看你是否有參加過其中一場吧～🤩

• 推廣活動
  • 1 月 動物行為暨生態研討會 @東海大學，與TBIA夥伴聯合擺攤，介紹生物多樣性資訊基礎概念與各自單位資料庫亮點。
  • 4 月 臺灣植物分類學會年會擺攤，推廣臺灣物種名錄與學名管理工具，並在現場示範操作及說明各項功能。
  • 5 月 522 國際生物多樣性日線上問卷活動，搭配 TBIA 年報亮點與聯盟夥伴粉絲頁串連。
  • 6 月 撰寫科學月刊 推廣資料開放：當開放資料遇上生物多樣性—TaiBIF 讓世界看見你的資料。
  • 12 月 生物多樣性資料庫共通查詢系統正式啟用記者會，與 TBIA 聯盟夥伴粉絲頁串連介紹各家資料庫與抽獎。

• 工作坊
  • 2 月 TaiCOL 學名管理工具使用教學工作坊 @線上
  • 5 月 TaiCOL 學名管理工具使用教學工作坊 @中山大學，並開放線上旁聽。
  • 5 月 第一場資料發布與應用工作坊 @中山大學，特別邀請生態檢核相關單位與長期生態研究人員參與。
  • 9 月 第二場資料發布與應用工作坊 @中研院 ：新增了資料應用課程—如何在 R 使用 rgbif 套件、清理 GBIF 下載的資料、製作物種分布地圖。
    

🌱志工培訓制度的建立及招募

• 推廣大使：協助工作坊教學，可進階成為講師。
• 資料清理協作者：配合資料發布者的需求，協助客製化的資料清理。
• 翻譯協作者：協助翻譯 GBIF 和生物多樣性資訊相關英文文件。
• 名錄資料協作者：2023年首次招募，協助 TaiCOL 補充名錄資料。

🌱社群交流

• 多場大專院校課程演講
• 生態資訊微型研討會協辦 1 場：透過開發台版寶可夢「野探」的國立臺灣大學生歷其境團隊、得到 NASA 黑客松最佳科學應用獎的 Ani’s Cuff 團隊、以及運用 AI 應用開放資料進行生態研究的中央研究院生物多樣性研究中心 X 國立臺灣大學生態學與演化生物學研究所等三個團隊介紹他們開發的工具，擴展大家對生物多樣性開放資料應用的想像。
• 兩篇資料應用案例介紹。
  • 與時間和森林類型相關的蛾類群聚動態
  • 沙錢海膽的親緣關係、祖先區域重建法與重新物種分類之研究探討
    

🌱促進生物多樣性資料的開放及支持科學研究

當開放資料量累積到一定程度，便能彌補許多研究資料在時間、空間、生物類群尺度上的不足，並藉由大數據分析、模式預測等將資料再利用，支持更多大尺度的科學研究。

• 資料發布情形：臺灣目前是亞洲生物多樣性開放資料第二多的國家。截至 2024 年 2 月 7 日在 GBIF 的資料平台上，臺灣發布至 GBIF 的資料 共有17,786,525 筆，來自 23 個臺灣的資料發布者，共 111 個資料集，發布資料至今的資料量歷年來快速增加中 。其中資料發布的類群以鳥類、昆蟲及開花植物為前三名，而兩棲類資料在 2023年也大幅增加。

• 資料論文合作：TaiBIF 與ＮGO黑潮海洋文教基金會合作發表鯨豚的資料論文 ，提供發表費補助及支援資料的開放。

• 協助開放資料及諮詢服務：TaiBIF 團隊成員協助國際學程研究生、國家生技園區、中油、生態顧問公司、黑潮、中山大學海科系、香港水母公民科學計畫、林業保育署、水利署、科博館等發布單位提供資料發布的諮詢服務 (如資料欄位建議、發布流程介紹、資料檢核等)。目前已發布的資料集有：花東賞鯨目擊資料集 、臺灣叫姑魚屬資料集 、拖網魚類資料集 、西部魚類群聚資料集 、西部頭足類群聚資料集 、eDNA 生物物種的出現紀錄 等等，另協助學生將 eDNA 基因序列公開於歐洲核酸序列資料庫 (ENA) 。

🌱連結臺灣與國際的生物多樣性資訊

TaiBIF 一直以來都與全球生物多樣性資訊機構 GBIF 保持密切的交流，也是亞洲區生物多樣性資訊領域上最為活躍並走在領域前端的節點 (沒有之一)。

• 8 月TaiBIF與 GBIF亞洲區諮詢支援團隊合作，共同於線上辦理亞洲區生物多樣性資料流通工作坊 (GBIF Asia data mobilization workshop)，分享經驗給GBIF亞洲區各節點的參與者。

• 10 月 TaiBIF 成員參與生物多樣性資訊標準國際年度會議 (Biodiversity Information Standards, TDWG)，口頭發表關於臺灣生物多樣性資訊聯盟 TBIA 的成立與推動任務成果 和臺灣物種名錄 (TaiCOL) 所開發分類研究工具 。並在同月作為臺灣的國家節點代表我國赴澳洲坎培拉參加 GBIF 第 30 屆理事會 (GB30 ) 暨全球節點會議，與此同時，端木茂甯副研究員另以亞洲區節點副代表 (Deputy Representative for Asian Nodes) 身份，參與節點指導小組 (Nodes Steering Group) 會議，討論節點跨區域的交流合作。

最後最後，能夠完成這麼多的成果，都要感謝國內有越來越多的資料擁有者或單位組織，願意透過 TaiBIF 所提供的平台發布資料並與國際網絡連結，也要感謝 TBIA及許多合作夥伴，大力支持並協助推廣資料開放的重要性，更富有熱忱地與我們持續探討各種生物多樣性資訊的議題。💪💪💪

不論未來的研究應用如何革新，TaiBIF將持續給予最大的支持，成為生物多樣性資訊基礎建設最強而有力的推動者。相信未來臺灣在生物多樣性領域的開放文化，能夠越趨成熟，展現更卓越的成果！