【資料應用案例介紹】生物版Google地球 - OneZoom 生命之樹與開放資料的應用

【資料應用案例介紹】生物版Google地球 - OneZoom 生命之樹與開放資料的應用

文 / 何芷蔚、劉璟儀 圖/ OneZoom.org

2021 年底,一站式線上互動生命地圖OneZoom的發表,驚豔了生物多樣性領域的愛好者,也讓生物多樣性資訊的相關單位(當然少不了我們 TaiBIF)感到既興奮又好奇。揪竟開發者是怎麼將地球上的所有生命串連起來的呢?就讓我們來瞭解一下吧!

OneZoom: https://www.onezoom.org/life.html/

OneZoom 是什麼?

灰色 葉片代表目前還未有足夠數據來證明這些生物的滅絕風險,開發者也強調,目前還有很多生物都未充分地被研究與了解;綠色 葉片代表該物種的族群數量目前未受到威脅;紅色深紅色 葉片代表族群數正在受威脅;黑色 代表已經在野外滅絕(呈葉片形狀)或已經從地球上消失(呈圓形)的物種。


Wong & Rosindell (2022). 不同顏色的葉片表示物種的滅絕風險。


資料應用的最佳實例:連結GBIF的開放資料

OneZoom 提升了人們對地球上的生物多樣性、演化史與滅絕風險的了解,而其背後所連結的各平台開放資料更是功不可沒,大大幫助了內容的整合與完整度。為了讓物種資訊更加豐富,開發團隊設計了點入物種葉片後可連結到其他資料庫的功能,包括了各大知名的資料平台如 GBIF 出現紀錄分布圖、Wikipedia、Encyclopedia of Life (EoL)、IUCN 紅皮書、NCBI GenBank 基因庫等。

連結各平台生物相關的開放資料是其中一個促進跨科學領域研究、應用和合作很好的例子,不僅可使這些資料被最大化地重複利用,也提升了它們的價值與效益,更大大地節省了各單位重新整合資料的時間和人力成本。

OneZoom 從版本3.5開始與GBIF資料庫連結,並在版本3.6開始顯示物種的世界分布資訊。

透過連結可至其他資料庫搜索該物種的相關資訊。圖為黃山松 Pinus taiwanensis 的在GBIF上的物種分布頁面。 OneZoom:https://www.onezoom.org/life.html/.

另外,本篇內容釋出的同時,OneZoom與GBIF團隊也正在討論即將開發且令人期待的優化功能 - 在GBIF網站檢視物種資料時,該頁面也會連到OneZoom生命之樹顯示該物種與其他物種的演化史資訊。這些跨平台的資料共享豐富了OneZoom與GBIF的物種資訊,讓使用者能更快速地了解這些物種。

總結

一個強大的整合搜尋平台的開發,有機會能同時滿足研究者、教育者、大眾,乃至政府單位的需求,而其背後的基礎,則是多年來所資料提供者(data publishers)願意開放並共享資料所累積的成果。OneZoom 的出現,提供了很棒的生物多樣性資料循環再利用的示範,也給了資料提供者一個很好的應用回饋。

參考資料

  1. Wong, Y. & Rosindell, J. (2022). Dynamic visualisation of million-tip trees: The OneZoom project. Methods in Ecology and Evolution, 13, 303–313. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13766
  2. 史上最完整 學者研發生物版Google Earth 200多萬物種一站式搜尋。環境資訊中心。https://e-info.org.tw/node/233229

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